עריסתה של הפדרציה היא בווינה, שם נוסדה בשנת 1925 בסמוך לקונגרס הציוני ה- 14 בראשה עמדו הרב עוזיאל מא"י , הרב שלם ודה פיצ'וטו. הקמתה נועדה למלא צורך מוראלי לשמירה על הגחלת ועל המסורת, אבל היא לא הצליחה להתמסד בגלל סיבות מסיבות שונות.
בשנת 1951 חזרו ויזמו וועדי העדות הספרדיות בירושלים, ת"א-יפו, חיפה וצפת את הרעיון לכינון הפדרציה העולמית של הקהילות הספרדיות המחודשת.
אסיפת היסוד התקיימה בקונגרס בפריז בשנת 1951 ובראשה עמדו שנים רבות, אשר בן רוי, סיר סבאג, מונטיפיורי והסגנים אליהו אלישר ז"ל ובכור שטרית ז"ל מישראל.
בין ראשי ומייסדי הקונגרס יש למנות את פרופ' רנה קאסן מצרפת, הרב הראשי עוזיאל מישראל, והרבנים דה סולה מניו יורק , אליהו אלישר, בכור שטרית ודוד סיטון.
ב – 1954 ברוב פאר והדר ובהשתתפות צירים ונציגים מכל העולם נפתח הקונגרס הספרדי השני בירושלים ושם הותוו הדרך והרעיונות של הפדרציה :
א. היהודים על כל שבטיהם הם עם אחד
ב. חובה על כולנו לעזור למדינת ישראל ולקיים מטרותיה הנשגבות.
ג. ביסוס וחיזוק מורשת ישראל רוחנית ותרבותית לקהילות השונות.
ד. שיתוף פעולה הדוק עם כל הארגונים העולמיים היהודיים לארגן את הציבור הספרדי אשר לא תהיה לו מגמה
פוליטית כלשהי.
פעילותה התרחבה ליבשת אמריקה וכן לארצות אירופה כמו: צרפת, אנגליה, איטליה וספרד.
ראשי הקהילות הספרדיות בגולה הצטרפו למאבק הציבורי לשיפור תנאי המתיישבים מאפריקה ומאסיה בישראל
תנופה מחודשת באה לפדרציה בשנת 1972 כאשר נסים ד. גאון מז'נבה נבחר לנשיא הפדרציה הספרדית העולמית . ניסים גאון ראה במדינת ישראל מרכז רוחני , מדיני ותרבותי של העם היהודית
עם היבחרותו ניהל משא ומתן עם יו"ר הסוכנות היהודית וההסתדרות הציונית – אריה פינקוס , בסופו נערך הסכם להצטרפות הפדרציה הספרדית העולמית כחברה בהסתדרות הציונית.
הסכם החברות כלל נציגות מכובדת: צרים לקונגרס הציוני בוועד הפועל הציוני, מושב בהנהלת ההסתדרות הציונית, בנציגות קק"ל, מושב חבר הנאמנים, והדבר החשוב ביותר מבחינה היסטורית לפדרציה הספרדית: הקמת המחלקה לקהילות ספרדיות בהסתדרות הציונית הכוללת תקציב שנתי וקרן למלגות, התכנית לפעילי ציבור המיועדת לבני עדות המזרח בישראל.
בשנת 1987 ערך גאון את הקונגרס הספרדי העולמי בירושלים, שהיווה שיא להתעוררות הפדרציה. הפדרציה הפכה למעורבת בכל הקשור לחיי היהודים בישראל ובגולה. בקונגרס זה נקבעו מוסדות הפדרציה הספרדית העולמית, הרכבה ומבנה הסניפים.
ניסים גאון נבחר לכהונה מחודשת כנשיא הפדרציה הספרדית העולמית, כיו"ר ועדת הכספים, מגביות וגזבר נבחר ליאון תמאן ז"ל.
ניסים גאון קבע מעמד מיוחד לסניף הישראלי וייעד עבורה 50% בכל הרכב של הפדרציה העולמית: 50% מצירי הקונגרס , 50% נציגים לפריזידיום וכממלא מקום הנשיא העולמי מינה את נשיא הפדרציה הספרדית בישראל.
הקונגרס מורכב מ – 200 צירים בחלוקה של : 100 צירים מהתפוצות , 100 צירים מישראל.
פריזידיום הכולל 30 איש: 15 מהתפוצות, 15 איש מישראל, וכמו כן חודשו הסניפים ומספר נציגים נבחר לייצגם בפריזידיום.
הסניפים הם: פסל"א – פדרציה ספרדית לטינו אמריקה, קנדה, ארה"ב אנגליה, איטליה, ספרד, טורקיה, מדינות הבלקן , שוויץ – ז'נבה
והסניף הגדול בישראל.
נשיא הפדרציה הספרדית העולמית, ניסים גאון, יליד סודן, משמש בתפקידו מזה כארבעים שנה.
ביוזמתו ובהכוונתו של ניסים גאון הושקעו משאבים רבים בתחום החינוך במטרה לסייע לתיקון האפלייה בשכבות החלשות. בין השנים 1970-1995 הועברו כמיליון ₪ ל – 15,000 מקבלי מלגות.
מזכ"ל הפדרציה הספרדית העולמית משנת 2002, דניאל חייק , יליד אלג'יריה (1960) , עלה ארצה משנת 1979, למד מדעי המדינה באוניברסיטה העברית בירושלים, משמש עיתונאי ושדרן ברדיו ליהודי צרפת.
גזבר הפדרציה הספרדית העולמית , יחזקאל זכאי, יליד כורדיסטאן (1932) עלה ארצה ב – 1950 .
עשר שנים שימש מדריך במושבי העולים . שימש כרכז תנועת המושבים בפרוזדור ירושלים. מנהל ארגון הקניות , מזכיר מפלגת העבודה במושבים, חבר כנסת ה תשיעית והעשירית, מנכ"ל מקורות, מנכ"ל משרד החקלאות, חבר במוסדות מפלגת העבודה.
משנת 1990 משמש ראש הפדרציה הספרדית בישראל, וכמנכ"ל ועד עדת הספרדים בירושלים.
| 
מאז ועד היום
